Думаю, требования работников НК не правомерны, если Вы не подпадаете под действие ниже приведенной статьи:
Закон Республики Казахстан от 31.01.2006 N 124-3
"О частном предпринимательстве"
Глава 6. Регистрация и ликвидация субъектов частного предпринимательства
Статья 28. Банкротство, реорганизация и ликвидация субъектов частного предпринимательства
2. Реорганизация или ликвидация субъекта частного предпринимательства, являющегося юридическим лицом, осуществляется в порядке, установленном для конкретной организационно - правовой формы частного предпринимательства.
3. Деятельность индивидуального предпринимателя может быть прекращена в добровольном либо принудительном порядке, а также в случае наступления обстоятельств, предусмотренных настоящим Законом.
4. В принудительном порядке деятельность индивидуального предпринимателя прекращается по решению суда в следующих случаях:
1) признания его банкротом;
2) признания недействительной регистрации индивидуального предпринимателя в связи с допущенными при регистрации нарушениями законодательства Республики Казахстан, которые носят неустранимый характер;
3) осуществления деятельности с неоднократными в течение календарного года или грубыми нарушениями законодательства Республики Казахстан.
5. Деятельность индивидуального предпринимателя, помимо оснований, предусмотренных настоящей статьей, прекращается также в следующих случаях:
1) личное предпринимательство - при признании индивидуального предпринимателя недееспособным, объявлении умершим или его смерти;
2) семейное предпринимательство и простое товарищество - если в результате наступления обстоятельств, перечисленных в подпункте 1) настоящего пункта, остался один или не осталось ни одного участника совместного предпринимательства, а также при разделе имущества в связи с расторжением брака.
6. Деятельность индивидуального предпринимателя считается прекращенной с момента исключения такого предпринимателя (предпринимателей) из Государственного регистра на основании его (их) заявления либо решения суда, вступившего в законную силу.
Исключение из Государственного регистра производится после сдачи в регистрирующий орган свидетельства о государственной регистрации индивидуального предпринимателя.