Тоже недавно столкнулась с такой проблемкой, когда очень многое надо поменять в Трудовом договоре.
Есть такое понятие
"Дополнительное согдашение к трудовому договору". И любые изменения, будь то условия работы, должность, кол-во дней отпука, оклад и прочее, можно вносить путем его составления. В целом оно похоже на Доп.соглашенние любого Контракта или Договора. Те же требования к заполнению.
Заключение нового ТД не рекомендуется,т.к. нет оснований для прекращения старых отношений. Возможно только подписание нового ТД. в котором непременно будет указано. что новый ТД является неотъемлемым приложением старого ТД. В принципе это и есть "Доп.соглашение к ТД"
http://forum.zakon.kz/lofiversion/index.php/t93703.html Здесь подробно обсуждают эту тему.
Всем удачи!